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CUT RUN Fast Kit一站式解決方案

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武漢艾美捷科技有限公司(Amyjet Scientific Inc)是一家具有*的技術實力、*的經營管理水平和完善的市場銷售體系的生物高科技企業。總部設在武漢,北京、成都設有分公司,服務面向全國。艾美捷科技集進口試劑、實驗室耗材銷售、技術服務與合約開發為一體的專業化高科技公司,旨在為生命科學的發展提供*的產品與服務。

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艾美捷科技有限公司致力于為廣大的科研機構、高等院校等客戶提供的產品、技術支持與服務。公司與國內外優秀的生物試劑供應商保持著密切的合作關系,目前已成為眾多品牌的中國總代理或一級代理,可以在*時間為用戶提供Z前沿的專業資訊和完備的產品和物流服務。

 

專業的技術力量使得我們能夠為廣大用戶提供強大的技術支持,深厚的人脈資源使得我們在全國主要城市擁有眾多的分支機構和合作伙伴,艾美捷科技有限公司非常榮幸能將世界上*的高科技產品*給國內從事生物學領域科研的老師和同仁。作為專業性的產品供應公司,公司出資存備了大量現貨,配合優秀的銷售隊伍以及專業的技術支持,隨時為客戶提供服務。

 

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EpiNext CUT&RUN Fast Kit,從低輸入提供無超聲破碎,以可靠地識別真正的目標蛋白質富集區域并實現高分辨率定位。可滿足快速富集蛋白質結合的DNA并繪制全基因組蛋白質/DNA相互作用的圖譜的需求。
CUT RUN Fast Kit一站式解決方案 產品詳情

作為ChIP的高效替代方案你可能不知道CUT&RUN有多專業,那小編就拿下面這篇文獻來分析一下吧~

 

文獻:Targeted in situ genome-wide profiling with high efficiency for low cell numbers

 

51.fw.png

 

隨著技術的發展,ChIP-seq的改進可以實現TFs 6-8堿基對分辨率的映射,但實驗結果還是存在很多問題,比如說ChIP的高背景限制了靈敏度,需要的細胞比較多以及交聯和增溶產生的假象。而CUT&RUN相比于傳統ChIP在細胞量和信噪比等方面的優勢。

 

1)在整個實驗過程中,pMNase的量對片段化的結果至關重要

 

52.jpg

fig1.兩批樣品500μl體積中,600,000K562細胞,加入不同濃度的pA-MN,片段化之后,采用TapeStation 通過分析熒光強度來分析pA-MNH3K27me3基因組片段化的影響。

 

2)CUT&RUN技術用于少量細胞,信噪比很好

 

研究者檢測了100-6000個K562細胞的H3K27me3的基因組分布,發現在低至100細胞時,CUT&RUN仍可以很好地檢測出H3K27me3的峰,而且在異染色質區也一樣可以看到峰。

 

53.jpg

fig2.CUT&RUN可以檢測低至100細胞的H3K27me3基因組分布(aENCODE數據庫中的K562細胞的H3K27me3 ChIP-seq結果,及6000-100K562細胞的H3K27me3 CUT&RUN結果。(bCUT&RUN結果的散點圖,以50bp為一個bin,相對于陰性對照IgG6000細胞與100細胞有明顯更強的相關性。(c)熱圖顯示6000-100細胞的CUT&RUN結果有很好的相關性。

 

3)CUR&RUN技術檢測的信噪比要比傳統ChIP-seq高很多

 

研究者檢測了轉錄因子CTCF的基因組結合位點,發現CUR&RUN技術檢測比ENCODECTCF ChIP-seq的信噪比要高很多,而且只需1.25萬細胞就能得到很高質量的結果。盡管用1000細胞則會損失一些峰。

54.jpg

fig3.用CUT&RUN檢測CTCF的結合位點,比ENCODE中的CTCF ChIP-seq信噪比高很多。

 

本文圖2、圖3分析源自CST公司。

艾美捷作為表觀遺傳領域專業的解決方案供應商,推薦EpiGentek的EpiNext CUT&RUN Fast Kit,cat#:P-2028,該試劑盒從低輸入提供無超聲破碎,以可靠地識別真正的目標蛋白質富集區域并實現高分辨率定位。可滿足您快速富集蛋白質結合的DNA并繪制全基因組蛋白質/DNA相互作用的圖譜的需求。


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