1) 進行實驗時，需關閉實驗室的門窗。
2) 每天實驗結束之後一定要滅菌實驗臺及安全操作裝置。如實驗中發生污染，需立即加以滅菌。
3) 與實驗有關之生物材料之廢棄物，需先滅菌後再依院方「感染性廢棄物管理」相關辦法丟棄。被污染的器具需先經高壓滅菌後，再清洗使用或丟棄。
4) 不得用口做吸量操作。
5) 實驗室內禁止飲食、吸煙及保存食物。
6) 操作重組體時需戴手套以防污染，操作完畢後及離開實驗室前需洗手或消毒。
7) 在所有的操作中，應儘量避免產生氣霧（例如，把燒熱的接種用白金環及接種針插入培養基時，若發生大量氣霧，就可能造成污染）。亦應避免將吸管或針筒內之液體用力射出。
8) 要從實驗室搬離被污染物品時，必需將其放入堅固且不外漏的容器，並在實驗室內密封之後，才可運出。
9) 防除實驗室的非實驗用生物，如昆蟲及鼠類等。
10)若有其他方法可用，應避免使用針頭。
11)實驗室內，要穿著實驗衣，離開前要脫掉。
12)禁止對實驗性質不了解的人進入實驗室。
13)實驗進行中，要在實驗室之入口，標示「P2級實驗室」，並掛上「P2級實驗進行中」的標示。而且保存重組體之冰箱及冷凍庫也要做同樣的標示。
14)實驗室要經常清理，保持清潔，不得放置與實驗無關的物品。
15)安全操作裝置內的HEPA過濾器，在更換前、定期檢查時及實驗內容變更時，需密封安全操作裝置，每立方公尺用10公克的甲醛燻蒸1小時，去除污染。
16)若在此級實驗室內同時進行P1級的實驗時，需明確劃分實驗區域，小心進行操作。
17)需遵守計畫主持人所規定之其他事項。
