Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜儀年度論文匯總
本文來源:賽默飛色譜及痕量元素分析 >>進(jìn)入該公司展臺(tái),轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處Orbitrap™ Astral™高分辨質(zhì)譜儀發(fā)布一年以來,在全球引起轟動(dòng),被很多組學(xué)研究工作者所青睞,行業(yè)內(nèi)專家驚呼“一款產(chǎn)品改變一個(gè)研究領(lǐng)域格局”,在質(zhì)譜產(chǎn)品發(fā)展如此多年來,實(shí)屬罕見。短短一年,共發(fā)表了超過44篇SCI論文,超過以往質(zhì)譜產(chǎn)品發(fā)布的10倍,真正成為科研神器。
當(dāng)然我們也梳理了發(fā)表文章研究領(lǐng)域,我們也驚奇的發(fā)現(xiàn)Astral不僅在傳統(tǒng)組學(xué)領(lǐng)域,包括疾病研究,翻譯后修飾研究,單細(xì)胞研究,空間蛋白質(zhì)組學(xué)研究,疫苗開發(fā),溶酶體研究,母乳研究等都有所突破。“想之前所不敢想,做之前所不敢做”,真正突破研究壁壘。
下面就讓我們走進(jìn)幾位學(xué)者發(fā)表文章,讓我們看看Astral如何幫助研究者突破研究壁壘。
磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)新突破
—— 驚人的鑒定深度
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實(shí)驗(yàn)室利用Nanomate直噴霧接口對(duì)于蛋白酶解樣本直接上樣,我們能夠在1分鐘內(nèi)使用200 ng細(xì)胞酶解肽段作為起始材料,在Orbitrap Astral上自信地鑒定出>1300個(gè)蛋白質(zhì)。
將方法進(jìn)一步優(yōu)化,在20s內(nèi)鑒定>85%的蛋白質(zhì),并且重復(fù)多次上樣,同樣穩(wěn)定獲得。
應(yīng)用優(yōu)化的策略使用Orbitrap Astral 對(duì)neat plasma樣本進(jìn)行了蛋白質(zhì)組深度評(píng)估,并成功在1分鐘的LC-MS/MS中使用窄窗口數(shù)據(jù)無關(guān)采集(nDIA)鑒定出>180個(gè)蛋白質(zhì),其中與FDA認(rèn)證的biomarker超過30多個(gè)。
單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)研究
—— 進(jìn)入新維度
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使用了細(xì)胞周期細(xì)胞HEK293以及原發(fā)性急性髓系白血病 Acute Myeloid Leukemia,(AML) 培養(yǎng)模型,來驗(yàn)證Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜儀儀器在單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)上的表現(xiàn)。
HeLa肽段,從鑒定結(jié)果來看,Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜儀在保持高質(zhì)量數(shù)據(jù)的前提下(大多數(shù)蛋白的cv值均小于20%),與Orbitrap Eclipse相比,其蛋白鑒定數(shù)增加了一倍。
測(cè)試來源相似的高度相似細(xì)胞的細(xì)胞異質(zhì)性的能力,對(duì)從4個(gè)群體中分別獲得的54個(gè)AML模型細(xì)胞進(jìn)行檢測(cè),在細(xì)胞群中鑒定到了3892個(gè)蛋白,每個(gè)細(xì)胞平均鑒定出超過2000個(gè)蛋白。對(duì)Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜儀鑒定到的蛋白進(jìn)行分析,很大一部分都是中低端豐度的蛋白,其中所鑒定到的轉(zhuǎn)錄因子增加了接近8倍,激酶數(shù)量增加了2倍。
這些數(shù)據(jù)說明Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜儀在單細(xì)胞水平檢測(cè)能力的增加對(duì)于提升我們的生物學(xué)認(rèn)知起到了關(guān)鍵的作用。
在細(xì)胞的異質(zhì)性檢測(cè)中,數(shù)據(jù)可以清晰地展現(xiàn)白血病模型中的表型多樣性,蛋白在細(xì)胞不同的分化階段表現(xiàn)出異質(zhì)性的表達(dá)模式,這說明單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)的數(shù)據(jù)捕獲到了非單細(xì)胞數(shù)據(jù)可能會(huì)遺漏的蛋白在不同細(xì)胞階段的漸進(jìn)變化。
Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜儀特點(diǎn)
提供創(chuàng)紀(jì)錄的快速通量性能,每年可以分析數(shù)以萬(wàn)計(jì)的樣本,8 分鐘高達(dá) 8000+ 的蛋白質(zhì)鑒定
蛋白組學(xué)更深層次覆蓋率,1 小時(shí)鑒定 12000+蛋白質(zhì)
更高靈敏度,每天分析60個(gè)單細(xì)胞,每個(gè)單細(xì)胞超過6000+個(gè)蛋白質(zhì)鑒定
更精準(zhǔn)的定量,能夠提供的可重復(fù)性測(cè)量鑒定蛋白質(zhì)的 CV 值在 4%~5% 之間
當(dāng)然我們收集了目前Orbitrap Astral發(fā)表文章列表,如果感興趣,請(qǐng)掃描以下二維碼獲取論文匯總文件。
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