近期，研究人員采用鏈特異性RNA測(cè)序（RNA-seq）和全基因組DNA測(cè)序，繪制了Bristol N2野生型線蟲(chóng)和三個(gè)ADAR突變體不同發(fā)育階段的RNA編輯圖譜。RNA編輯通過(guò)轉(zhuǎn)錄后插入、刪除或修飾RNA分子上的某些堿基，增加轉(zhuǎn)錄組多樣性。研究人員發(fā)現(xiàn)RNA編輯發(fā)揮重要的作用，如改變神經(jīng)遞質(zhì)或離子通道的特定密碼子、創(chuàng)建新的剪接位點(diǎn)、修飾miRNA種子序列及其靶位點(diǎn)，并通過(guò)與RNAi通路競(jìng)爭(zhēng)而保護(hù)前體mRNA。

    RNA編輯是所有多細(xì)胞動(dòng)物中的一個(gè)普遍現(xiàn)象。zui主要的RNA編輯是A(adenosine)-to-I(Inosine) 的修飾，其受到蛋白酶ADAR（adenosine deaminases that act on RNA )的催化調(diào)控，ADARs對(duì)于哺乳動(dòng)物*，但是它們?cè)?/span>A-to-I編輯中的個(gè)體效應(yīng)仍不明確。ADAR1+/?突變小鼠如果造血系統(tǒng)有缺陷，在胚胎期14天之前就會(huì)死亡。ADAR1+/?小鼠逐漸傾向于在P12后癲癇發(fā)作及早逝。

    在無(wú)脊椎動(dòng)物中，果蠅（Drosophila melanogaster）有一個(gè)單一的ADAR2樣基因，稱(chēng)為Dmel\Adar (也稱(chēng)為dADAR)，刪除這個(gè)基因可導(dǎo)致運(yùn)動(dòng)失調(diào)和溫度敏感麻痹。秀麗隱桿線蟲(chóng)（Caenorhabditis elegans）有兩個(gè)ADAR基因——adr-1和adr-2，但是它們?cè)?/span>A-to-I編輯中各自發(fā)揮什么作用仍不清楚。缺乏一個(gè)或兩個(gè)基因的線蟲(chóng)是可育的，只表現(xiàn)出輕微的趨化性缺陷，這使線蟲(chóng)成為研究ADARs影響的*模型。

   zui近，新一代測(cè)序和生物信息學(xué)技術(shù)被用于在人類(lèi)和果蠅中識(shí)別基因組規(guī)模上的數(shù)百萬(wàn)個(gè)RNA編輯事件。然而，線蟲(chóng)中的RNA編輯圖譜在很大程度上還是未知的。到目前為止，在線蟲(chóng)中只有10個(gè)基因已發(fā)現(xiàn)在非編碼區(qū)被編輯。RNA編輯是否在不同的發(fā)育階段被調(diào)控，也尚不明確。

   在這項(xiàng)研究中，研究人員采用鏈特異性RNA測(cè)序（RNA-seq）和全基因組DNA測(cè)序，繪制了Bristol N2野生型線蟲(chóng)和三個(gè)ADAR突變體不同發(fā)育階段的RNA編輯圖譜。該研究小組還開(kāi)發(fā)出一種新的計(jì)算程序，用“bisulfite-seq-mapping-like"步驟，獲得了識(shí)別敏感度的三倍增加。在基因簇中發(fā)現(xiàn)了共99.5%的A-to-I編輯位點(diǎn)。在3080個(gè)編輯簇中，65.7%的與非編碼區(qū)域中的DNA轉(zhuǎn)座子重疊，73.7%的能夠形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)。