分離操作條件的選擇
1．載氣及其流速的選擇
對一定的色譜柱和試樣，有一個的載氣流速，此時柱效zui高，根據下式
H=A+B/u+CU
用在不同流速下的塔板高度H對流速u作圖，得H-u曲線圖。在曲線的zui低點，塔板高度Hzui小（Hzui小）。此時柱效zui高。該點所對應的流速即為流速u，及 Hzui小可由式（14-17）微分求得：

當流速較小時，分子擴散（B項）就成為色譜峰擴張的主要因素，此時應采用相對分子質量較大的載氣（N2，Ar ），使組分在載氣中有較小 的擴散系數。而當流速較大時，傳質項（C項）為控制因素，宜采用相對分子質量較小的載氣（H2,He ），此時組分在載氣中有較大的擴散系數，可減小氣相傳質阻力，提高柱效。
2．柱溫的選擇
柱溫直接影響分離效能和分析速度。首先要考慮到每種固定液都有一定的使用溫度。柱溫不能高于固定液的zui高使用溫度，否則固定液揮發流失。
3．固定液的性質和用量
固定液對分離是起決定作用的。一般來說，擔體的表面積越大，固定液用量可以越高，允許的進樣量也就越多。為了改善液相傳質，應使液膜薄一些。固定液液膜薄，柱效能提高，并可縮短分析時間。 固定液的配比一般用5：100到25：100，也有低于5：100的。不同的擔體為要達到較高的柱效能，其固定液的配比往往是不同的。一般來說，擔體的表面積越大，固定液的含量可以越高。
4．擔體的性質和粒度
要求擔體的表面積大，表面孔徑分布均勻。這樣，固定液涂在擔體表面上成為均勻的薄膜，液相傳質就快，柱效就可提高。擔體粒度均勻、細小，也有利于柱效提高。但粒度過小，柱壓降增大，對操作不利。
5．進樣時間和進樣量
進樣必須快，一般在一秒鐘之內。進樣時間過長，會增大峰寬，峰變形。進樣量一般液體0.1-5微升，氣體0.1-10毫升，進樣太多，會使幾個峰疊加，分離不好。
6．氣化溫度
在保證試樣不分解的情況下，適當提高氣化溫度對分離及定量有利。