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siPOOL文庫,使您獲得值得信賴的RNAi篩選結(jié)果

來源:藍(lán)景科信河北生物科技有限公司   2023年08月07日 15:36  

siPOOL文庫:改進(jìn)和節(jié)省您的RNAi篩選實驗

siPOOL文庫中的每個基因均被混池化的30條siRNA靶向

為什么要做RNA干擾(RNAi)?

RNA干擾(RNAi)是一種廣泛用于研究基因功能的基因沉默工具。這是由于它擁有多種優(yōu)勢:易于使用、適用于各種細(xì)胞類型、類似藥物的特性、可快速獲得結(jié)果等。然而,合成的短干擾RNA(siRNAs)通常會存在脫靶效應(yīng),這將導(dǎo)致實驗結(jié)果的不穩(wěn)定,因此后續(xù)還需要開展更多的驗證工作,既費時又費力。 如果采用高復(fù)雜度的siRNAs池(簡稱siPOOLs),可以大大降低脫靶效應(yīng),進(jìn)一步提高RNAi方法在基因功能研究中的可靠性和效率。


siPOOLs如何提高特異性?

siPOOLs是由優(yōu)化設(shè)計合成的30條siRNA組成的復(fù)雜混池。采用高復(fù)雜度的混池方法,使每條siRNA的濃度均相應(yīng)降低,致使特異性siRNA的脫靶效應(yīng)得以稀釋。相反地,siPOOLs具有較高的轉(zhuǎn)錄組覆蓋率,可以進(jìn)一步提高基因敲除的效率。由此產(chǎn)生的功能表型結(jié)果也更加的可靠,重復(fù)性也更好。


左:在相對較高的濃度下使用單個siRNA或低復(fù)雜度siRNA池,以實現(xiàn)有效的敲除。然而,高濃度可能會導(dǎo)致普遍的脫靶效應(yīng),從而產(chǎn)出易變的結(jié)果。右:siPOOLs是由30條特定的siRNAs構(gòu)成的復(fù)雜混池,具有不同的種子序列,能夠較大限度地覆蓋靶標(biāo)基因。采用混池化方法將每條siRNA的濃度降低。較低的濃度可有效消除脫靶效應(yīng),并提高基因沉默結(jié)果的可靠性。


我們提供專業(yè)的技術(shù)支持

我們的團(tuán)隊是由具備多年RNAi篩選經(jīng)驗的專家組成,在siRNA設(shè)計和RNAi篩選數(shù)據(jù)分析(包含siRNA和基于shRNA的篩選)方面有深入的專業(yè)研究,可以為您的RNAi檢測開發(fā)和篩選研究提供科學(xué)、專業(yè)的技術(shù)支持。


與時俱進(jìn)的siPOOL文庫

為了確保siPOOLs針對當(dāng)前注釋的基因,設(shè)計團(tuán)隊會根據(jù)新版的RefSeq注釋不斷更新siPOOL的設(shè)計。

產(chǎn)品名稱

物種

規(guī)格

產(chǎn)品編號

E3 Ligase siPOOL library

E3連接酶siPOOL庫

human

1 nmol

si-L010-000E3L

human

0.5 nmol

si-L005-000E3L

human

0.25 nmol

si-L002-000E3L

human

0.1 nmol

si-L001-000E3L

Kinase siPOOL library

激酶siPOOL庫

human

1 nmol

si-L010-000505

human

0.5 nmol

si-L005-000505

human

0.25 nmol

si-L002-000505

human

0.1 nmol

si-L001-000505

RNA-binding protein siPOOL library

RNA結(jié)合蛋白siPOOL庫

human

1 nmol

si-L010-000RBP

human

0.5 nmol

si-L005-000RBP

human

0.25 nmol

si-L002-000RBP

human

0.1 nmol

si-L001-000RBP

GPCR siPOOL library

GPCR siPOOL庫

human

1 nmol

si-L010-00GPCR

human

0.5 nmol

si-L005-00GPCR

human

0.25 nmol

si-L002-00GPCR

human

0.1 nmol

si-L001-00GPCR

Ubiquitinase siPOOL library

泛素化酶 siPOOL庫

human

1 nmol

si-L010-000UBI

human

0.5 nmol

si-L005-000UBI

human

0.25 nmol

si-L002-000UBI

human

0.1 nmol

si-L001-000UBI

通常,siPOOLs產(chǎn)品采用攜帶條形碼的離心管。也可根據(jù)客戶需求定制96孔板或384孔板布局的siPOOLs產(chǎn)品。


運輸和保存

siPOOL庫,以懸液的形式保存,常溫(RT)下運輸。如有特別要求,siPOOL也可以干粉形式運輸。siPOOL庫可以穩(wěn)定地在RT下運輸至少4周。到達(dá)后,siPOOL庫應(yīng)存儲在-20℃至-80℃。在這樣的條件下,siPOOL庫至少穩(wěn)定保存兩年。如果siPOOL庫以干粉形式運輸,siPOOL需采用無RNase的水進(jìn)行重懸。

在客戶收到(或重懸)siPOOLs產(chǎn)品后,我們建議您將siPOOLs分裝成小體積,存儲在-20℃到-80℃條件。為了達(dá)到最佳效果,盡量減少反復(fù)凍融的次數(shù)。在良好的儲存條件以及規(guī)范的操作處理下,siPOOLs可穩(wěn)定保存至少2年。


引用文獻(xiàn)

Hannus M. et. al.: siPools: highly complex but accurately defined siRNA pools eliminate off-target effects. Nucleic Acids Res 42(12): 8049-61(2014)

Marine S. et. al.: Common Seed Analysis to Identify Off-Target Effects in siRNA Screens. Journal of Biomolecular Screening 1-9 (2011)

Jackson A. et. al.: Expression Profiling reveals off-target gene regulation by RNAi. Nature Biotechnology (2003)


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