目前，用氣相色譜儀檢測農殘等物質具有準確、快速、高效等特點，但因其系統的復雜性，往往有時出現問題，而讓檢測者找不到原因。ECD檢測器又是比較嬌嫩的檢測器，很容易受到干擾和污染。因此在痕量檢測中，盡量注意其異常情況及污染防治問題，以確保其靈敏性和準確性。
農殘檢測氣相色譜儀ECD檢測被污染的清洗辦法有：
①一般采用增高檢測器經度（在允許的溫度范圍內），使用空柱，同時通入大流量高片氨氣，進行較長時間的灼燒、吹掃。可進適當的較大劑量的純溶劑進行清洗；
②對于較為嚴重的污染，在使用前法沒有效果時，可選擇合適的溶劑，在超聲波清洗器中清洗兩個小時，然后用水清洗干凈、烘干。因ECD具有放射性，所以本方法請專業人士操作。
預防農殘檢測氣相色譜儀ECD檢測污染的注意事項
①采用高純N2（純度高于99.99%），同時要注意高純N2中的H2O級O2等雜質，將高純N2通過脫氧處理后進入氣相色譜儀；
②次使用或長期停機后重新開啟檢測器時，應用大流量高純N2，在檢測器允許的溫度下吹掃色譜儀管路達24小時以上。若停機時間較短，不要中止氮氣流，只需將流量減小，以維持色譜系統正壓；
③新填裝或久置不用的柱子必須在允許溫度下，以120ml/min的載氣流速，連續吹洗，老化24小時以上；
④正常運行時，檢測器溫度必須高于柱溫，柱溫一般要遠低于固定液或固定相的使用溫度；
⑤溶劑要充分純化，盡可能不采用電負性強的溶劑；
⑥進樣量要掌握適當，盡量不要過大。