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不同細(xì)胞培養(yǎng)強(qiáng)化工藝的生物反應(yīng)器生產(chǎn)率和培養(yǎng)基成本比較

來源:廣州市艾貝泰生物科技有限公司   2025年02月27日 15:31  

Xu S , Gavin J , Jiang R ,et al.Bioreactor productivity and media cost comparison for different intensified cell culture processes[J].Biotechnology Progress, 2017, 33(4).DOI:info:doi/10.1002/btpr.2415.


介紹:

采用同一培養(yǎng)基對(duì)同一株CHO細(xì)胞系進(jìn)行補(bǔ)料培養(yǎng)(fed-batch正常接種密度)或補(bǔ)料培養(yǎng)(fed-batch,N-1灌流再高接種密度)、灌流和濃縮補(bǔ)料批培養(yǎng)(CFB)三種細(xì)胞培養(yǎng)操作模式的評(píng)價(jià)。可比較的細(xì)胞比生產(chǎn)率(補(bǔ)料批:29.4 pg/cell/day;N-1灌流補(bǔ)料批:32.0 pg/ cells /day;灌流:31.0 pg/細(xì)胞/天;在相同的培養(yǎng)基條件下,CFB為20.1 ~ 45.1 pg/cell/day)。灌流(高達(dá)2.29 g/L/day)和CFB(高達(dá)2.04 g/L/day)的生物反應(yīng)器生產(chǎn)率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于補(bǔ)料批培養(yǎng)(范圍為0.39至0.49 g/L/day)。此外,發(fā)現(xiàn)灌流產(chǎn)生的每克抗體的培養(yǎng)基成本與補(bǔ)料批的培養(yǎng)基成本相當(dāng);而CFB因其培養(yǎng)時(shí)間短,其培養(yǎng)基成本高。只要達(dá)到足夠的生物反應(yīng)器生產(chǎn)率,灌流過程的培養(yǎng)基成本甚至可以低于補(bǔ)料工藝。

 

目前,大部分的生產(chǎn)能力是為補(bǔ)料批工藝建立的。補(bǔ)料批工藝的峰值細(xì)胞密度在20-30×106個(gè)細(xì)胞/mL,18天內(nèi)達(dá)到了>10g/L的高滴度水平。灌流工藝傳統(tǒng)上用于生產(chǎn)不穩(wěn)定的產(chǎn)品,如酶產(chǎn)品。在灌流培養(yǎng)中,連續(xù)培養(yǎng)基交換用于減少產(chǎn)物在生物反應(yīng)器中的停留時(shí)間,灌流速率可根據(jù)特定產(chǎn)品和/或工藝要求而變化。

 

由于對(duì)成本和空間減少以及設(shè)施靈活性的期望,基于灌流的工藝強(qiáng)化在上游培養(yǎng)中獲得了相當(dāng)大的動(dòng)力。通常可以實(shí)現(xiàn)50-60×106個(gè)細(xì)胞/mL的穩(wěn)定細(xì)胞密度,最近有報(bào)道稱,在每個(gè)生物反應(yīng)器每天2個(gè)培養(yǎng)基交換體積(vvd)下,單克隆抗體生產(chǎn)的生物反應(yīng)器生產(chǎn)率高達(dá)4g/L/天。在維持1.9 g/L/day的生物反應(yīng)器生產(chǎn)力的同時(shí),還可以實(shí)現(xiàn)15 pL/ cells /day的極低細(xì)胞特異性灌流率(CSPR)(培養(yǎng)基交換率為1 vvd)。濃縮補(bǔ)料(CFB)工藝也采用培養(yǎng)基交換來保持較高的細(xì)胞密度,同時(shí)保留生物反應(yīng)器中的產(chǎn)物。

 

本文展示了使用相同的基礎(chǔ)培養(yǎng)基和補(bǔ)料液,開發(fā)具有高生物反應(yīng)器生產(chǎn)率的不同細(xì)胞培養(yǎng)工藝(補(bǔ)料、灌流和CFB)。進(jìn)一步比較了不同工藝模式下的生物反應(yīng)器生產(chǎn)率及其相關(guān)的培養(yǎng)基成本。

 

圖片

 

三種不同工藝模式

 

不同工藝模式下的細(xì)胞培養(yǎng)性能

均采用相同的3 L生物反應(yīng)器配置:補(bǔ)料、灌流和濃縮補(bǔ)料(CFB)。在所有三種工藝模式中都使用了相同的基礎(chǔ)培養(yǎng)基和補(bǔ)料(feed-a和feed-b)。

補(bǔ)料批培養(yǎng)

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補(bǔ)料批培養(yǎng)數(shù)據(jù)

 

補(bǔ)料批方式接種密度為0.5或2×106個(gè)/mL。在2×106個(gè)細(xì)胞/mL的條件下使指數(shù)生長期縮短2天,第8天密度達(dá)到峰值,而不是在0.5×106細(xì)胞/mL的接種密度條件下第10天。兩種條件下的峰值細(xì)胞密度均在20.2-26.2×106cells/mL范圍內(nèi)。0.5×106個(gè)細(xì)胞/mL接種密度條件下,最終存活率為92.5±0.9%,2×106個(gè)細(xì)胞/mL接種密度條件下,最終存活率為82.4±4.8%。在早期指數(shù)階段產(chǎn)生有限的抗體。兩種條件下,從指數(shù)期到穩(wěn)定期的后期,產(chǎn)品滴度均以每日0.55-0.63g/L的速率增加,表明兩種條件下的生產(chǎn)速率具有可比性。第14天滴度為5.4±0.1 g/L(qP為29.4±2.2 pg/cell/day)和6.8±0.2 g/L (qP為32.0±2.3 pg/cell/day)

 

生物反應(yīng)器容量產(chǎn)率計(jì)算為最終生物反應(yīng)器滴度除以培養(yǎng)時(shí)間。2×106細(xì)胞/mL接種密度條件下的體積產(chǎn)率(VPR)高于0.5×106細(xì)胞/mL接種密度條件下的(0.49±0.01 g/L/d vs.0.39±0.01 g/L/d),主要是因?yàn)樗s短了初始生長階段的時(shí)間,延長了生產(chǎn)階段。高接種密度條件下,補(bǔ)料量以葡萄糖水平為基礎(chǔ),與細(xì)胞密度有關(guān),因此補(bǔ)料量較高。0.5×106個(gè)細(xì)胞/mL接種密度條件下,平均補(bǔ)料量為48%(占生物反應(yīng)器初始體積的百分比),2×106個(gè)細(xì)胞/mL接種密度條件下,平均補(bǔ)料量為52%。這可能是在2×106個(gè)細(xì)胞/mL接種密度條件下qP略高的原因。


灌流培養(yǎng)

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灌流培養(yǎng)數(shù)據(jù)

 

整個(gè)灌流培養(yǎng)過程中保持>85%的高活力。在基礎(chǔ)培養(yǎng)基條件下,平均細(xì)胞密度維持在44.0±4.1×106個(gè)細(xì)胞/mL,從第8天到第32天的日生產(chǎn)力為0.70±0.04 g/L/天。在灌流培養(yǎng)中,由于產(chǎn)品直接從灌流側(cè)收獲,因此生物反應(yīng)器的體積生產(chǎn)力計(jì)算為灌流滴度×灌流率。到灌流培養(yǎng)結(jié)束時(shí),每日產(chǎn)物收獲率(灌流滴度/生物反應(yīng)器滴度)仍在80%。


在基礎(chǔ)培養(yǎng)基+補(bǔ)料條件下,隨著細(xì)胞密度的增加,逐漸加入feed-a作為交換培養(yǎng)基的一部分,同時(shí)總交換培養(yǎng)基保持1vvd。增加總培養(yǎng)基交換中feed-a的含量,直到第12天達(dá)到總培養(yǎng)基交換的10%,并在剩余的培養(yǎng)時(shí)間內(nèi)保持該水平。隨著補(bǔ)料添加量的增加,平均細(xì)胞密度增加到73.9±5.4×106個(gè)細(xì)胞/mL,每日生物反應(yīng)器體積生產(chǎn)力增加到2.29±0.28 g/L/day。與僅在基礎(chǔ)培養(yǎng)基條件下相比,增加培養(yǎng)基可提高穩(wěn)定細(xì)胞密度和滴度。

總體而言,細(xì)胞特異性生產(chǎn)力從16.0±1.2 pg/cell/day增加到30.1±2.3 pg/cell/day。結(jié)果表明,在基礎(chǔ)培養(yǎng)基+補(bǔ)料條件下,生物反應(yīng)器生產(chǎn)率提高了230%。

 

濃縮補(bǔ)料批(CFB

圖片

濃縮補(bǔ)料培養(yǎng)數(shù)據(jù)

 

與灌流過程類似,對(duì)僅基礎(chǔ)培養(yǎng)基條件和基礎(chǔ)+補(bǔ)料條件進(jìn)行評(píng)估。添加額外的補(bǔ)料可提高細(xì)胞培養(yǎng)性能和體積生產(chǎn)力。僅在基礎(chǔ)培養(yǎng)基條件下,峰值細(xì)胞密度達(dá)到72.0±9.6×106個(gè)細(xì)胞/mL,第18天的上清滴度為12.2±0.6 g/L。對(duì)于基礎(chǔ)培養(yǎng)基+補(bǔ)料條件,在培養(yǎng)基交換中評(píng)估兩種不同的補(bǔ)料量:條件1使用6%的feed-a和2%的feed-b,條件2使用8%的feed-a和8%的feed-b。條件1產(chǎn)生的峰值細(xì)胞密度為117.4×106個(gè)細(xì)胞/mL,第18天的上清滴度為21.4 g/L。條件2的峰值細(xì)胞密度為83.4×106個(gè)/mL,第18天上清滴度為36.7 g/L。在條件2中,當(dāng)feed-a和feed-b的添加量增加時(shí),細(xì)胞比生產(chǎn)力顯著提高到45.1 pg/cell/day。獲得的qP與高生產(chǎn)率補(bǔ)料批工藝中報(bào)告的水平相似。雖然基礎(chǔ)培養(yǎng)基+補(bǔ)料條件下的存活率下降速度快于單獨(dú)純基礎(chǔ)培養(yǎng)基條件,但最終存活率仍維持50%~70%。在相同的培養(yǎng)條件下(例如,僅基礎(chǔ)培養(yǎng)基條件),基于ATF的CFB工藝(50kD)可以產(chǎn)生比灌流(0.2µm)更高的活細(xì)胞密度。


細(xì)胞特異性生產(chǎn)率、生物反應(yīng)器生產(chǎn)率和產(chǎn)品質(zhì)量

為了比較不同工藝間qP和VPR的差異,當(dāng)僅使用基礎(chǔ)培養(yǎng)基時(shí),批培養(yǎng)、灌流和CFB處理的qP范圍為14.7-17.1 pg/cell/day。批量培養(yǎng)的VPR僅為0.08 g/L/day,而灌流和CFB工藝由于保持了較高的細(xì)胞密度,VPR在0.68 - 0.70 g/L/day之間。補(bǔ)料培養(yǎng)qP提高到29.4 ~ 32.0 pg/ cells/ day,VPR達(dá)到0.39 g/L/day (0.5×106個(gè)細(xì)胞/mL接種密度)或0.49 g/L/day(2×106個(gè)細(xì)胞/mL接種密度),N-1灌流的高接種密度提高了VPR,因?yàn)樗s短了生長期的時(shí)間,延長了生產(chǎn)力高的穩(wěn)定期的持續(xù)時(shí)間。然而,在灌流和CFB過程中,由于細(xì)胞密度的顯著差異,補(bǔ)料批培養(yǎng)的VPR仍然低于基礎(chǔ)條件下的VPR。在灌流培養(yǎng)中添加10%的feed-a,與僅在基礎(chǔ)條件下相比,VPR提高了約230% (2.29 g/L/day vs. 0.70 g/L/day),qP提高了約90%(30.1 pg/cell/day vs. 16.0 pg/cell/day)。同樣,在CFB工藝中,添加不同比例的feed-a和feed-b可將VPR提高至1.19 g/L/d(6%feed-a + 2%feed-b)和2.04 g/L/d(8%feed-a + 8%feed-b)。

 

所有工藝均獲得了可接受的電荷變化曲線和聚集水平。與其他兩種工藝相比,CFB工藝產(chǎn)生了更高水平的HMW和略高的酸性變體,這主要是由于產(chǎn)品所處的細(xì)胞培養(yǎng)環(huán)境。產(chǎn)品在補(bǔ)料批和CFB中的停留時(shí)間可達(dá)整個(gè)培養(yǎng)周期,其中CFB工藝的停留時(shí)間最長。盡管如此,產(chǎn)生的HMW小于5%,并且大多數(shù)可以通過純化步驟清除。

 

對(duì)于傾向于聚集的分子,需要仔細(xì)檢查CFB工藝,以確保可接受的產(chǎn)品質(zhì)量屬性。例如,當(dāng)CFB工藝延長到29天,在基礎(chǔ)培養(yǎng)基條件下觀察到酸性變異和高分子量的增加,即使產(chǎn)品抗體濃度也大幅增加。另一方面,即使在相同的高細(xì)胞密度環(huán)境和培養(yǎng)基成分相似,灌流培養(yǎng)產(chǎn)生低酸性變異和高分子量低,可能是因?yàn)楫a(chǎn)品的短停留時(shí)間在生物反應(yīng)器(1vvd使用,產(chǎn)品連續(xù)運(yùn)出生物反應(yīng)器,停留時(shí)間為3天)。總的來說,所有的工藝模式和培養(yǎng)基條件都產(chǎn)生了可接受的電荷變化和聚集曲線。


培養(yǎng)基成本分析

當(dāng)只使用基礎(chǔ)培養(yǎng)基時(shí),每克抗體的培養(yǎng)基成本在補(bǔ)料批和灌流過程中都很高。當(dāng)在補(bǔ)料批和灌流過程中使用適量的補(bǔ)料時(shí),可以降低每克mAb培養(yǎng)基成本。盡管補(bǔ)料比基礎(chǔ)培養(yǎng)基貴,但細(xì)胞密度和qP的增加比培養(yǎng)基成本的增加更為顯著。N-1灌流補(bǔ)料的培養(yǎng)基成本低于正常補(bǔ)料批,這是由于在N-1灌流過程中,只需3倍的基礎(chǔ)培養(yǎng)基交換即可獲得高接種密度,并且滴度的增加超過了培養(yǎng)基使用量的增加。兩種條件下,N-1灌流和灌流(基礎(chǔ)培養(yǎng)基+10%feed-a)的補(bǔ)料批的培養(yǎng)基成本相當(dāng),約為10美元/g mAb。在灌流培養(yǎng)中需要3 vvd的灌流率才能保持60×106個(gè)細(xì)胞/mL的細(xì)胞密度,并且預(yù)計(jì)1 vvd的改進(jìn)過程可以保持相同的細(xì)胞密度,從而使灌流工藝在CoGs(cost of goods)方面有利。

 

CFB的培養(yǎng)基成本不符合其他工藝模式的趨勢(shì)。在基礎(chǔ)培養(yǎng)基條件下,成本(17.5美元/g mAb)與批培養(yǎng)和灌流工藝相當(dāng)。與補(bǔ)料批和灌流不同,在CFB工藝中使用補(bǔ)料液時(shí),培養(yǎng)基成本實(shí)際上增加了。例如,當(dāng)使用補(bǔ)料條件1時(shí),成本增加到19.6美元/g mAb。在這種特殊情況下,生物反應(yīng)器生產(chǎn)率的提高不足以彌補(bǔ)與所使用的補(bǔ)料培養(yǎng)基相關(guān)的高成本。在補(bǔ)料條件1下,邊際細(xì)胞比生產(chǎn)力由17.1±1.3 pg/cell/day提高到20.1 pg/cell/day。隨著條件2補(bǔ)料量的進(jìn)一步增加,qP和VPR均顯著提高。結(jié)果,培養(yǎng)基成本降至17.0美元/g mAb,僅略低于基礎(chǔ)條件下17.5美元/g mAb的培養(yǎng)基成本。與CFB工藝相關(guān)的高培養(yǎng)基成本主要是由于需要相當(dāng)長的細(xì)胞生長時(shí)間。直到培養(yǎng)第10天細(xì)胞密度達(dá)到峰值水平時(shí),滴度才顯著增加。因此,盡管在補(bǔ)料條件2下,CFB工藝的qP和日生產(chǎn)率很高,但每g mAb的培養(yǎng)基成本遠(yuǎn)高于補(bǔ)料批和灌流工藝的10美元/g mAb。對(duì)于CFB工藝,降低培養(yǎng)基成本的一種方法是延長批次長度,提高使用壽命;然而,這必須仔細(xì)檢查,因?yàn)樵谏锓磻?yīng)器中停留時(shí)間較長可能會(huì)影響產(chǎn)品質(zhì)量屬性。當(dāng)CFB延長到更長的持續(xù)時(shí)間時(shí),已經(jīng)觀察到酸性變體和HMW的增加。


總    結(jié)

比較了不同工藝模式下的生物反應(yīng)器生產(chǎn)率,包括補(bǔ)料、灌流和CFB工藝。與灌流培養(yǎng)(灌流培養(yǎng)為2.29 g/L/d,CFB培養(yǎng)為1.19 - 2.04 g/L/d)相比,補(bǔ)料培養(yǎng)具有低的生物反應(yīng)器生產(chǎn)率(0.39 - 0.49 g/L/d),因?yàn)榫S持的細(xì)胞密度要低得多。灌流的顯著優(yōu)勢(shì)是能夠達(dá)到并保持非常高的細(xì)胞密度,以形成產(chǎn)物,這可以抵消在基礎(chǔ)條件下相對(duì)較低的qP。灌流的一個(gè)缺點(diǎn)是涉及高培養(yǎng)基成本,因?yàn)樾枰B續(xù)的培養(yǎng)基交換來維持所需的高活細(xì)胞密度。高產(chǎn)量灌流培養(yǎng)的培養(yǎng)基成本(2.29±0.28 g/L/d)實(shí)際上可以低于補(bǔ)料工藝(第14天滴度為6.8±0.2 g/L)。這部分是由于灌流時(shí)使用的低細(xì)胞特異性灌流率(14±1 pL/細(xì)胞/天)在18天內(nèi)達(dá)到36.7 g/L的上清滴度。CFB工藝的培養(yǎng)基成本也是高的。這在很大程度上是由于CFB培養(yǎng)沒有灌流培養(yǎng)那么長,而且培養(yǎng)時(shí)間的很大一部分用于細(xì)胞生長而不是產(chǎn)物形成。

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