PCR反應條件優化控制：

1.  PCR反應的緩沖液提供合適的酸堿度與某些離子 。 

2.  鎂離子濃度 總量應比dNTPs的濃度高，常用1.5 mmol/L。　

3.  底物濃度dNTP以等摩爾濃度配制，20～200 umol/L。　

4.  TaqDNA聚合酶2.5U(100 ul）。　　

5.  引物 濃度一般為0.1 ～0.5 umol/L。

6.  反應溫度

（1）變性溫度和時間95℃，30 s。

（2）退火溫度和時間 低于引物Tm值5 ℃左右，一般在45～55℃。

（3）延伸溫度和時間72℃，1 min/kb(10 kb內）。

（4）Tm值=4(G+C) +2(A+T)

7.  循環次數 ：一般為25 ～30次。循環數決定PCR擴增的產量。模板初始濃度低，可增加循環數以便達到有效的 擴增量。但循環數并不是可以無限增加的。一般循環數為30個左右，循環數超過30個以后，DNA聚合酶活性逐漸達到飽和，產物的量不再隨循環數的增加而增加，出現了所謂的“平臺期”。