國家長江朱沱水質自動監測站作為我國個水質自動監測站，至今已經平穩運行11年，并多次獲得國家環境監測總站表彰。為強化水環境監測，2010年，重慶市環境監測中心對朱沱水站進行了全面改造，擴建、整修了監測實驗區，升級、組裝了儀器設備，同時新增了部分便攜式儀器設備及有機物監測儀器。截至6月，已完成了全面改造工作。目前，該水站的監測參數主要包括WTW公司水質五參數、韓國公司高錳酸鹽指數、捷安捷公司JAWA-1005型氨氮、INFICON 公司VOC揮發性有機物以及Apptick公司生物毒性。其中INFICON 公司VOC揮發性有機物監測儀國內僅有無錫、瀘州、武漢等8個水站配備，而Apptick公司生物毒性監測儀器國內僅有朱沱、宜賓、瀘州三個水站配備。此次全面改造將大大提升長江入境斷面重慶段的監測能力為環境監測和環境管理提供可靠準確的技術支持。