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PCR擴增完成后需要進行瓊脂糖凝膠電泳檢測，在條帶單一無其他雜帶的情況下，可以直接對產物進行純化。提升PCR產物純化效率要點合集如下：
1.模板純度，有較多蛋白或其他雜質時，會一定程度影響pcr效率；
2.模板量，過高的模板量反而會降低pcr效率特異性；
3.引物，引物的長度需要再效率和特異性間獲得優化，其次要控制引物gc含量；
4.聚合酶，要考慮酶的保真率和速度；
5.mg離子濃度，mg離子濃度過高會降低特異性，濃度過低會降低效率；
6.退火溫度：退火溫度低，效率會高，但特異性降低；退火溫度高，效率降低，但特異性會提高，需優化。
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