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藍景科信河北生物科技有限公司
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三大技術如何聯手揭開PAC1腫瘤免疫的神秘面紗？2025/05/13
在醫學研究前沿，腫瘤免疫治療是備受矚目的“主戰場”?？蒲腥藛T努力尋找新靶點和治療新機制，卻困難重重。腫瘤微環境抑制T細胞功能，讓宿主抗腫瘤防線脆弱。T細胞功能障礙的真相不明，現有免疫治療手段難以治愈腫瘤。此時，尋找T細胞特異性抑制途徑成為破局關鍵。而CUT&Tag、ATAC-seq和ChIP-seq這三大技術，宛如三把“神兵利器”，在這場與腫瘤的較量中發揮了關鍵作用。經典文獻解讀2020年1月，在《NatureImmunology》發表的題為“ThephosphatasePAC1actsasaT
染色質開放性測序（ATAC-seq）2025/04/30
技術簡介染色質開放性測序（AssayforTransposase-AccessibleChromatinusingsequencing，ATAC-seq），一種用于檢測染色質開放性的高通量測序技術，通過Tn5轉座酶切割并標記開放的染色質區域，從而揭示基因組中調控元件（如增強子、啟動子）的位置和活性。技術原理在真核生物中，DNA并不是裸露存在的，而是與組蛋白等結合形成染色質。染色質的結構狀態會影響基因的表達，那些處于開放狀態的染色質區域，更容易與轉錄因子等蛋白結合，進而啟動基因的轉錄過程。ATAC
ATAC-seq開啟新視角：探索Shox2基因沙漠的神秘功能2025/04/30
2024年7月，發表在《NatureCommunications》的一篇文章“AgenedesertrequiredforregulatorycontrolofpleiotropicShox2expressionａndembryonicsurvival”，聚焦Shox2基因下游的基因沙漠，綜合運用多種前沿技術，揭示了基因沙漠在調控Shox2基因多效性表達、胚胎存活及組織發育中的關鍵作用。該研究中，ATAC-seq技術發揮了重要作用。它通過檢測染色質的可及性，幫助研究人員篩選出在心臟組織中特異性開
ChIP-seq（染色質免疫共沉淀測序）2025/04/27
技術簡介染色質免疫沉淀測序（ChromatinImmunoprecipitationSequencing，ChIP-seq）是一種將染色質免疫共沉淀（ChIP）與二代測序技術（NGS）相結合，用于研究蛋白質與DNA的相互作用的技術。技術原理將染色質免疫共沉淀和高通量測序相結合，通過目的蛋白的特異性抗體，將目的蛋白-DNA復合物沉淀下來，從而獲取該目的蛋白結合的DNA。再通過DNA高通量測序，獲得該蛋白在染色體上的分布情況。利用該技術不僅可以檢測轉錄因子在全基因組上的結合位點，還可以研究各種組蛋白
《Nature》|揭秘TH17細胞分化“開關”：ChIP-seq 技術破解基因調控密碼2025/04/27
2017年發表在Nature上的“ReversingSKI–SMAD4-mediatedsuppressionisessentialforTH17celldifferentiation”的文章揭示了TGFβ的“反向調控”策略：正常情況下，SMAD4蛋白與抑制因子SKI形成復合物，像“基因剎車”一樣抑制TH17核心轉錄因子RORγt的表達；而TGFβ通過誘導SKI降解，解除這一抑制，最終激活TH17分化程序。更重要的是，研究發現的SKI-SMAD4信號軸，為靶向調控TH17細胞提供了全新治療靶點。
客戶文章|DAP-seq技術助力揭秘葡萄耐冷性的糖代謝調控機制2025/04/27
2025年4月8日，中國科學院武漢植物園辛海平研究員團隊在Plant,Cell&Environment期刊(IF=6.1)上發表了題為“VaEIN3.1‐VaERF057‐VaFBA1ModulePositivelyRegulatesColdTolerancebyAccumulatingSolubleSugarinGrapevine”的研究論文，旨在揭示VaEIN3.1-VaERF057-VaFBA1模塊如何通過調控可溶性糖積累增強葡萄耐冷性，為抗逆分子育種提供新靶點。該研究利用DAP-seq技
DAP-seq技術助力揭示擬南芥根基本組織發育的調控機制2025/04/21
2024年11月18日，蘭州大學黎家教授團隊在《CurrentBiology》（IF=8.1）發表了題為“ThreeRLKsintegrateSHR-SCRａndgibberellinstoregulaterootgroundtissuepatterninginArabidopsisthaliana”的研究論文，該研究揭示了受體激酶ARH1、FEI1和FEI2共同調控根基本組織發育的分子機制，并借助DAP-seq技術發現SHR和SCR可能通過與其他調節蛋白的相互作用來抑制這些RLK的表達。研究背
DAP-seq（DNA親和純化測序）2025/04/14
無需特異性抗體，無需轉基因材料，物種不限（動物，植物，微生物），高通量檢測轉錄因子在全基因組的結合位點藍景科信擁有200+物種，3000+轉錄因子的實驗經驗，周期短，口碑好，助力客戶發表高分文章Cell，MolPlant，PlantCell，PlantPhysiol，PlantBiotechnolJ，JIntegrPlantBio，NewPhytol等。在基因功能組學和表觀遺傳學研究中，轉錄因子結合位點（TranscriptionFactorBindingSites,TFBS）的發掘一直是研究熱
客戶文章（Plant Com) ▏DAP-seq助力揭示甘藍型油菜早花的遺傳機制2025/04/14
突破性發現！油菜BnaC3.LFY基因內含子變異調控開花時間，助力精準育種。DAP-seq和RNA-seq聯合分析雙劍合璧，結合SV-GWAS結果，從多個維度進行深度的數據挖掘，更全面、更深入地理解生命活動的奧秘。2025年3月15日，浙江大學朱楊課題組在《PlantCommunications》（IF=9.4）上發表了題目為“TheIntronicStructureVariationofRapeseedBnaC3.LEAFYRegulatestheTimingofInflorescenceFo
多聚核糖體分析（Polysome Profiling）2025/04/14
技術簡介基因表達在多個層面上受到調控，包括：表觀遺傳水平調控、轉錄水平調控、翻譯水平調控以及翻譯后修飾調控。其中，翻譯調控控制著蛋白質的生物合成以響應生理和病理的變化。而且，翻譯水平的調控也深刻影響了蛋白質的豐度。研究翻譯水平的調控機制，有助于深入理解基因表達調控機制，并且可以解釋轉錄組和蛋白質組分析之間的差異。多聚核糖體分析（Polysomeprofiling）是研究翻譯調控機制常用的技術。Polysomeprofiling通過蔗糖密度梯度超速離心分離freemRNA、40S和60S核糖體亞基
RNA免疫共沉淀測序（RIP-seq）2025/04/14
技術簡介RNA免疫共沉淀測序（RNAImmunoprecipitationSequencing,RIP-seq）是一種將RNA免疫共沉淀（RIP）與二代測序技術（NGS）相結合，用于研究細胞內RNA與蛋白相互作用的技術。技術原理利用目標蛋白的特異性抗體將相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來，經過富集和純化后，對結合在復合物上的RNA進行高通量測序，從而在全轉錄組范圍內分析細胞內RNA與蛋白的結合情況，揭示RNA分子與RNA結合蛋白（RBP）的相互作用，包括非編碼RNA與蛋白的互作。實驗流程圖應用領域
Ribo-seq——檢測正在翻譯的RNA信息，連接轉錄組學與蛋白質組學的橋梁2025/04/10
Ribo-seq技術原理翻譯（Translation）是基因表達的關鍵步驟，是指信使RNA（mRNA）攜帶的遺傳信息被核糖體解碼并轉化為特定氨基酸序列的過程。蛋白質翻譯的調控是高度精準、多層次、動態化的過程。在全基因組水平上，轉錄與翻譯經常存在顯著差異。通過轉錄組測序鑒定的上調表達基因中，只有其中20%在蛋白水平上調。核糖體印跡測序（Ribosomeprofiling,Ribo-seq），能夠精細解析細胞內的翻譯過程。Ribo-seq的技術核心是識別與核糖體結合的RNA，以及正在被翻譯的約30個
RBP研究技術RIP-seq+Polysome profiling2025/04/08
【RNA結合蛋白ARID5A驅動IL-17依賴性自身抗體誘導的腎小球腎炎】自身抗體介導的腎小球腎炎（AGN）是由腎臟炎癥失調引起的重大健康問題，盡管現有的治療方法可以提高生存率，但效果有限，而且副作用嚴重。因此，迫切需要改進的治療方法。IL-17在AGN中的作用已被廣泛研究，但其下游的分子信號以及調控機制仍不清楚。最近研究發現，RNA結合蛋白ARID5A(AT-richinteractivedomain-containingprotein5a)在AGN中顯著上調，并在IL-17依賴性腎臟炎癥中發
m6A MeRIP-seq聯合Ribo-seq的研究思路2025/04/03
文章題目：METTL16exertsanm6A-independentfunctiontofacilitatetranslationａndtumorigenesis發表期刊：NatureCellBiology(5年影響因子：24.2)研究單位：BeckmanResearchInstituteofCityofHope，TheUniversityofChicago，CityofHopeComprehensiveCancerCenter等。主要內容：METTL16作為一種最近被鑒定的RNA甲基轉移酶，
Cell文獻：轉座子外顯化構成了一個受進化選擇的功能蛋白質亞型儲庫2025/03/24
轉座子（TransposableElements，TEs），又稱轉座元件，指在基因組中能夠移動或復制，并可以整合到基因組新位點的一段DNA序列?？勺兗艚樱ˋlternativeSplicing，AS），又稱選擇性剪接，是指從一個mRNA前體中通過不同的剪接方式產生不同的mRNA剪接異構體的過程?？勺兗艚釉谡婧松镏袕V泛存在，為蛋白質組提供了多樣性?？勺兗艚右圆煌姆绞皆鰪姷鞍踪|的多樣性，包括通過轉座子的外顯子化。最近的轉錄組學分析確定了數千個具有外顯子化轉座元件的未注釋剪接轉錄本，但它們對蛋白質
喜報！又一篇Mol Plant文章發表！DAP-seq技術助力客戶挖掘水稻香氣調控機制2025/03/17
捷報頻傳！繼頂刊Cell、兩篇MolecularPlant之后，我們的客戶再下一城，又一研究成果強勢登陸MolecularPlant！本期，小編將帶您深入解讀這篇最新發表的文章，希望能為您的科研之路帶來啟發與靈感！2024年11月11日，海南大學/崖州灣國家實驗室羅杰教授團隊在《MolecularPlant》（IF=17.1）發表了題為“Volatilome-basedGWASidentifiesOsWRKY19ａndOsNAC021askeyregulatorsofricearoma”的研究論
利用dDAP-seq技術解析轉錄因子的DNA結合特性2025/03/07
文章名稱：DoubleDAP-sequncoveredsynergisticDNAbindingofinteractingbZIPtranscriptionfactors期刊：Naturecommunications發表時間：2023年5月5日一、研究背景轉錄因子（TF）相互作用對基因表達的組合調控至關重要，bZIP轉錄因子的二聚化對其功能發揮意義重大，但同源和異源二聚體在DNA結合和功能特異性方面的分子機制尚不清楚。此前研究多使用合成寡核苷酸，無法充分體現基因組的序列多樣性和結合位點背景。為深
motif分析工具——MEME-CHIP2025/03/03
揭秘基因調控的鑰匙：深度解析MEME-CHIP，你的motif分析神器你是否好奇基因是如何被精確調控的？DNA中的“密碼片段”——motif，正是轉錄因子結合的關鍵位點，它們如同基因開關，控制著生命活動的節奏。今天，我們將帶你認識一款強大的motif分析工具MEME-CHIP，從功能亮點到實操指南，一文掌握！一、Motif分析：為什么選擇MEME-CHIP？Motif是DNA、RNA或蛋白質中頻繁出現的短序列模式，能通過結合其他分子調控基因表達。目前主流工具包括HOMER（HomerSoftwa
客戶文章 ▏DAP-seq技術助力揭示水稻氮素吸收直接途徑和菌根途徑的新機制2025/02/24
2025年2月18日，南京農業大學徐國華、陳愛群教授團隊在PNAS期刊(IF=9.4)上發表了題為“OsNLP3ａndOsPHR2orchestratedirectａndmycorrhizalpathwaysfornitrateuptakebyregulatingNAR2.1-NRT2scomplexesinrice”的研究論文，該研究利用DAP-seq技術，系統的闡明了兩個轉錄因子OsNLP3和OsPHR2協同調控硝酸鹽轉運蛋白復合體NAR2.1-NRT2s介導的氮素吸收直接途徑和菌根途徑的分
Deepseek問答：我篩選到一個植物轉錄因子，如何進行后續的實驗設計2025/02/14
很多用戶驚奇地發現，頂級域名ai·com被定向到DeepSeek。如今在瀏覽器地址欄輸入ai·com，用戶會直接打開DeepSeek登錄頁面。那么，DeepSeek到底對我們科研工作者有什么樣的助益呢？小編也來提出一個問題，實際上手來體驗一下。答：一、基礎驗證與生物信息學分析1.基因與蛋白結構驗證序列比對：通過NCBIBLAST確認基因序列準確性，比對同源物種的轉錄因子（如AP2/ERF、MYB、bHLH家族）。結構域分析：使用InterPro、Pfam等工具預測DNA結合域（如鋅指、Leu
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