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藍景科信河北生物科技有限公司
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[2024年DAP-seq客戶文章盤點]致敬每一篇文章的作者2025/02/08
2025年的第一個工作日，小編踏著晨光，心中充滿了新的希望和期待。街道上，冬日的寒風被溫暖的陽光所驅散，仿佛預示著這一年的美好開端。我每一步都踏得堅定而有力，心中默念著新年的目標與夢想。推開公司的大門，伴隨著熟悉的同事們的問候聲，一盆綠植在陽光下顯得格外生機勃勃，仿佛也在歡迎我的歸來。打開電腦，屏幕上跳出的新年祝福郵件讓我不禁微笑，心中涌起一股暖流。回首2024年，小編初入藍景科信團隊，回憶這一年工作的點點滴滴，看到團隊取得的成績，感受到了工作的意義和樂趣。2024年，我們團隊與客戶老師攜手共進
DAP-seq助力揭示蘋果MYB54轉錄因子調控細胞壁防御機制2025/01/15
2024年12月11日，西北農林科技大學馬鋒旺-李超團隊在ThePlantJournal期刊（IF=6.2）發表了題為“MdMYB54reducesdiseaseseveritycausedbyFusariumsolaniinapplebymodulatingcellwallcelluloseａndpectatelyase-dependentdefense”的研究論文，該文章借助DAP-seq技術，揭示了蘋果MYB54轉錄因子通過調節細胞壁纖維素和果膠裂解酶依賴的防御機制以減輕病害。研究背景蘋果
Cytoscape-基礎使用手冊2025/01/08
文章標題：IdentificationofplasmamiR-4505,miR-4743-5pａndmiR-4750-3pasnoveldiagnosticbiomarkersforcoronaryarterydiseaseinpatientswithtype2diabetesmellitus:acase-controlstudy發表年限：2024年期刊：CardiovascularDiabetology影響因子：8.5研究背景2型糖尿病（T2DM）和冠狀動脈疾病（CAD）是常見的共存臨床疾病，
利用picoMeRIP-seq技術揭示m6A修飾在小鼠卵母細胞和胚胎發育早期的重要作用2025/01/08
N6-甲基腺苷（m6A）是真核生物中RNA最常見的內部修飾，在多種生物過程，如RNA穩定性、剪接、轉運和翻譯中發揮關鍵調控作用。但檢測所需大量的RNA阻礙了哺乳動物早期胚胎中的m6A分析。本研究通過應用低起始量的甲基RNA免疫沉淀和測序技術（picoMeRIP-seq），成功繪制了小鼠卵母細胞和著床前胚胎中N6-甲基腺苷（m6A）修飾的動態圖譜，揭示了m6A修飾在調控早期胚胎發育、基因表達、母體到合子轉換過程中的關鍵作用，以及m6A通過在逆轉錄轉座子衍生的RNA上的富集來維持基因組穩定性和細胞特
Polysome Profiling助力揭示小核仁RNA SNORA13調控細胞衰老的分子機制2024/12/30
【中文題目】一個小核仁RNA(SNORA13)在核糖體生成和衰老中的非經典作用研究【文章題目】Anon-canonicalroleforasmallnucleolarRNAinribosomebiogenesisａndsenescence【發表期刊】Cell（影響因子45.5）【發表時間】2024年8月22日【研究團隊】美國德克薩斯大學JoshuaT.Mendell團隊【研究概要】細胞衰老是一種由各種應激引起的不可逆的細胞周期停滯狀態，包括異常的癌基因激活、端粒縮短和DNA損傷。通過全基因組篩選
DAP-seq——藍景科信（無需特異性抗體，無需轉基因材料，省時省力）2024/12/25
無需針對每種蛋白制備特異性抗體，無需構建轉基因體系，高通量檢測轉錄因子及DNA結合蛋白的結合位點。藍景科信為您提供DAP-seq全流程技術服務和個性化數據分析，具有100多個物種，2000多個轉錄因子的實驗經驗，已協助很多客戶成功發表文章。例如：MolecularPlant，ThePlantCell，PlantPhysiology，PlantBiotechnologyJournal，JournalofIntegrativePlantBiology，NewPhytologist，Cell等。在基因
客戶文章|DAP-seq助力揭示SmHSFA8調控茄子耐熱性機制2024/12/23
2024年12月17日，華南農業大學園藝學院曹必好教授團隊在Plant,Cell&Environment（中科院一區Top期刊，影響因子7.6）在線發表了題為SmHSFA8enhancestheheattoleranceofeggplantbyregulatingtheSmEGY3-SmCSD1moduleａndpromotingSmF3H-mediatedflavonoidbiosynthesis的研究論文。該文章借助DAP-seq技術探究了SmHSFA8通過調控SmEGY3-SmCSD1模塊
WGCNA分析流程及內容解讀2024/12/06
文章標題：通過WGCNA和機器學習識別和驗證與免疫和氧化應激相關的糖尿病腎病診斷標記物發表年限：2023年期刊：FrontiersinImmunology影響因子：5.7研究背景：糖尿病腎病（DN）以蛋白尿、高血壓和腎功能進行性減退為特征，是發達國家終末期腎病最常見的病因，造成了嚴重的社會和經濟負擔。研究表明，隨著全球糖尿病發病率的上升，DN患者的人數也在不斷增加，預計在未來20年左右的時間里，全球糖尿病發病率將從5.37億人上升到7.83億人。與此相反，目前的治療方案強調腎素-血管緊張素系統阻
文章分享 | 基因沙漠：調控Shox2基因多效性表達與胚胎發育的關鍵區域2024/11/20
文章題目：AgenedesertrequiredforregulatorycontrolofpleiotropicShox2expressionａndembryonicsurvival發表時間：2024.10.10發表平臺：NatureCommunications影響因子：IF14.7Q1DOI:10.1038/s41467-024-53009-7研究背景Shox2基因是一個重要的轉錄因子，在多個組織和器官的發育中起著關鍵作用。特別是在顱面、顱神經、中/后腦和肢體等區域的發育中，Shox2基因的
客戶文章 | DAP-seq助力揭示番茄抗酸鋁分子調控新機制2024/10/23
2024年10月2日，云南農業大學園林園藝學院營養逆境與品質改良楊建立/范偉團隊在HorticultureResearch期刊(IF=7.6)上在線發表題為“SlST0P1-regulatedSlHAK5expressionconfersAltoleranceintomatobyfacilitatingcitratesecretionfromroots”的研究論文。該研究通過DAP-seq和RNA-seq在全基因組水平挖掘了番茄抗酸鋁核心轉錄因子SlST0P1互作位點，明確了受SlST0P1直接
RNA Pull Down和RIP的技術應用2024/10/15
RNAPullDown和RIP的技術應用：ELF18誘導的lncRNAELENA1與MED19a互作增強擬南芥免疫反應植物和動物在自然環境中都面臨著被各種微生物感染的風險。與動物一樣，植物也演化出了一套模式識別受體（PRRs），這些受體能識別整個微生物病原體類別的分子特征，進而啟動先天免疫反應。本文鑒定了擬南芥中一種長非編碼RNA（lncRNA）-ELENA1，通過InVitroRNAPull-Down、RIP等技術揭示了ELENA1調控擬南芥抗病性的機制。1、ELENA1通過受體依賴途徑表達為
客戶文章 | DAP-seq助力揭示MYC2轉錄因子調控銀杏萜內酯生物合成的分子機制2024/10/09
銀杏萜內酯是銀杏中重要的天然藥用活性成分，具有抗血栓、抗炎、治療心腦血管疾病和預防阿爾茨海默病等藥理活性，也是血小板活化因子的強拮抗劑。萜內酯在銀杏中的含量極低，難以滿足醫藥行業的需求，限制了銀杏產業的發展和臨床應用。因此，弄清銀杏萜內酯基因調控網絡，可為培育高萜內酯含量銀杏優良品種提供作用靶點和理論基礎。2024年8月9日，HorticultureResearch在線發表了長江大學許鋒教授課題組題為ThetranscriptionfactorMYC2positivelyregulatester
翻譯組學研究技術介紹和應用2024/10/09
翻譯組學簡介轉錄組數據能夠評估蛋白質的表達水平，然而，越來越多的研究結果表明，mRNA的豐度和蛋白質的豐度存在較大差異。這主要是由于在翻譯過程中存在復雜的調控機制。蛋白質可以通過質譜技術直接量化蛋白質的豐度，但無法檢測出mRNA的翻譯效率和蛋白質的合成速率。因此，迫切需要一種創新性技術，成為轉錄組學和蛋白質組學的重要橋梁和樞紐。因此，翻譯組學恰逢其時地應運而生。在核糖體上以mRNA為模板進行翻譯的示意圖翻譯組學(Translatomics)是一種對核糖體結合的RNA進行捕獲和測序的技術，通過對正
客戶文章 | DAP-seq助力揭示GhSBI1調控棉花果枝節間伸長的分子機制2024/09/26
2024年7月26日，中國農業科學院棉花研究所張永山研究員團隊在PlantBiotechnologyJournal（影響因子10.1）雜志上發表了題為“GhSBI1,aCUP-SHAPEDCOTYLEDON2homologue,modulatesbranchinternodeelongationincotton”的文章，該研究借助DAP-seq和轉錄組等技術，鑒定了GhSBI1下游靶標基因，揭示了其對棉花果枝節間伸長的抑制作用機制。研究背景：棉花（Gossypium）是世界上主要的天然纖維來源，
文章分享 | 翻譯調控增強神經系統中細胞類型的區分2024/09/24
文章標題：翻譯調控增強神經系統中細胞類型的區分發表年限：2024年研究背景對基因轉錄和翻譯的精準調控可以定義細胞的特殊形態和功能。利用單細胞轉錄組測序技術鑒定差異表達基因，在轉錄水平揭示細胞多樣性調控機制研究已有很多報道，但是翻譯水平的調控機制對細胞類型影響仍有待闡明。在本文中，作者以果蠅為研究模型，聚焦于頭部的神經元細胞與神經膠質細胞。這兩類細胞都由同一種神經干細胞分化而來，神經元細胞的主要功能是突觸和電信號傳導，而神經膠質細胞的作用是形成血腦屏障并充當免疫細胞。盡管兩類細胞類型不同，它們的轉
新技術！蛋白質與RNA互作研究新技術：RNA親和純化測序（RAP-seq）2024/09/11
蛋白質和RNA是具有緊密關系的生物分子，能夠通過物理相互作用參與完成細胞的周期并調控細胞的生物學過程。如果干擾了它們的正常相互作用，將會導致細胞功能紊亂，影響植物的生長發育。因此，研究RNA與蛋白質的相互作用，對于理解細胞內分子調控機制和植物的生長發育機理具有重要意義。以蛋白質為中心鑒定與蛋白質結合的RNA，傳統的方法是使用特異性抗體進行免疫共沉淀，鑒定出與蛋白質結合的RNA，比如RNAimmunoprecipitations（RIP）、Cross-linkingａndimmunoprecipi
喜報！DAP-seq文章6連發，總IF 95.22024/08/06
2024年4月29日，河北農業大學林學院李保國山區產業開發與林果產業創新團隊與園藝學院田義教授團隊聯合西北農林科技大學馬鋒旺教授團隊及沈陽農業大學馬躍教授團隊在PlantBiotechnologyJournal（影響因子10.1）上發表了題為“TheMdVQ37-MdWRKY100complexregulatessalicylicacidcontentandMdRPM1expressiontomodulateresistancetoGlomerellaleafspotinapples”的研究論文
DAP-seq助力揭示OsbZIP10-OsGIF1分子模塊調控稻米品質的作用機制2024/07/19
水稻是世界重要的糧食作物，全球約有三分之一的人口以水稻為主食。隨著人口的增長和飲食結構的改變，在對水稻產量的需求不斷增加的同時，對稻米品質的追求也在不斷提高。稻米品質包括食味品質、外觀品質和營養品質等多個方面，其中，直鏈淀粉含量是影響食味品質的重要因素之一。然而，稻米的食味和外觀品質的調控機制復雜，至今只闡明了一部分。2024年7月9日，上海市農科院、安徽農業大學、浙江大學海南研究院等多家單位聯合在ThePlantJournal（影響因子6.2）發表了題為“Transcriptionfactor
客戶文章 | DAP-seq技術助力揭示MdWRKY75調控蘋果耐熱性的分子機制2024/07/04
2024年6月12日，西北農林科技大學作物抗逆與高效生產全國重點實驗室/園藝學院蘋果抗逆與品質改良創新團隊馬鋒旺教授/李超課題組在植物學期刊ThePlantCell（影響因子10）在線發表了題為“TheMdHSC70-MdWRKY75modulemediatesbasalapplethermotolerancebyregulatingtheexpressionofheatshockfactorgenes”的研究論文，揭示了MdHSC70-MdWRKY75模塊調控MdHsfs參與蘋果耐熱性的新機制
文章分享 | seq-DAP-seq和ChIP-seq聯合檢測揭示花發育器官轉錄因子調控機制2024/06/28
技術簡介MADS轉錄因子的同源蛋白SEPALLATA3(SEP3)和AGAMOUS(AG)是調控擬南芥花發育分化的重要DNA結合蛋白。在雌蕊發育階段，SEP3和AG形成異源四聚體，通過識別CArG-box序列來調控基因的表達。Seq-DAP-seq技術與ChIP-seq聯合使用，可用于分析轉錄因子的DNA結合域與基因組的互作。文獻速遞2020年發表在NucleicAcidsResearch上的“Genome-widebindingofSEPALLATA3ａndAGAMOUScomplexesde
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