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藍景科信河北生物科技有限公司
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Int J Biol Macromol | DAP-seq助力揭示水稻抗病新機制2025/07/16
研究背景水稻在生長過程中會遭受多種生物脅迫，其中稻瘟病、細菌性葉枯病和紋枯病是破壞性較大的三大病害，會造成全球范圍內的糧食減產。植物激素如茉莉酸（JA）等可介導復雜的信號網絡以激活水稻的免疫反應。MYC轉錄因子是JA信號的主要調節因子，而泛素化作為重要的蛋白質翻譯后修飾，在植物免疫中發揮關鍵作用。此前研究發現水稻RING型E3泛素連接酶OsBBI1可正向調控水稻對稻瘟病的抗性，但其作用機制尚不明確。文獻解讀2025年6月，浙江大學生物技術研究所宋鳳鳴團隊在《InternationalJourna
DAP-seq技術服務常見問題解答：從樣本準備到數據分析2025/07/16
想做DAP-seq實驗，卻滿腦子疑問？別擔心，這篇攻略為你一次性解答所有關鍵問題，助你輕松開啟實驗之旅！一、DAP-seq是什么？能幫我解決啥問題？DAP-seq技術的核心原理先在體外表達帶有特定標簽（如His、Halo標簽）的目的蛋白，讓其與標簽配體結合后，再與基因組DNA共同孵育，最后洗脫結合的DNA片段進行高通量測序和生物信息分析。核心優勢它能幫你快速鎖定轉錄因子的結合位點，找到其調控的下游靶基因。更給力的是，這項技術無需特異性抗體，無需轉基因材料，即可揭示轉錄因子與DNA的互作網絡，如今
國自然熱門領域解析：一文讀懂組蛋白修飾的奧秘2025/07/16
組蛋白修飾是表觀遺傳調控的核心機制之一，通過共價修飾（如甲基化、乙酰化等）改變染色質結構，從而精確調控基因表達，決定細胞的功能和發展方向。作為國家自然科學基金重點支持的研究領域，其分子機制和生物學功能已成為當前生命科學研究的焦點。接下來，我們就來深入了解組蛋白修飾的具體情況。組蛋白結構組蛋白是染色質的核心組成成分，其結構為基因調控奠定了堅實的物質基礎。染色質由DNA與蛋白質組成的復合物，核小體作為染色質的基本結構單元，由147個堿基對的DNA緊密纏繞在組蛋白八聚體上構成。這種結構使得長達數米的D
[應用指南] Ribo-seq在神經科學方向的研究思路2025/07/11
Ribo-seq簡介Ribo-seq（RibosomeProfiling，核糖體印跡測序，翻譯組測序），通過識別與核糖體結合的mRNA，對正在翻譯的RNA片段（即核糖體保護片段，RibosomeProtectFragments,RPFs）進行捕獲和測序分析。其核心原理是利用低濃度RNase處理核糖體-新生肽鏈復合物時，未被核糖體覆蓋的mRNA會被降解，而被核糖體保護的約28~30bp的RNA小片段，即核糖體足跡（ribosomefootprints，RFP）得以保留。Ribo-seq技術的革命性
【科研手冊】系統發育分析——MEGA保姆級使用教程2025/07/11
在生物學研究中，系統發育分析是揭示物種進化關系的核心手段，而MEGA（MolecularEvolutionaryGeneticsAnalysis）軟件憑借其強大功能與友好界面，成為科研人構建系統發育樹的得力助手。無論是剛入門的科研小白，還是想提升分析效率的老手，這篇全流程教程都能幫你輕松掌握MEGA系統發育分析的核心操作！一、前期準備：數據與軟件就位1.數據獲取首先，需要準備用于分析的序列數據，可以是DNA、RNA或蛋白質序列。常見的數據來源包括NCBI數據庫、Ensembl數據庫等。下載數據時
ChIP-seq還是ChIP-qPCR？如何選擇？2025/07/08
在生命科學研究領域，探究蛋白質與DNA之間的相互作用，是理解基因表達調控機制的關鍵。染色質免疫沉淀（ChIP）技術作為研究這一相互作用的經典方法，衍生出了ChIP-seq和ChIP-qPCR兩種重要技術手段。當我們面對實驗需求時，究竟該選擇ChIP-seq還是ChIP-qPCR呢？不少科研人員常常陷入“選擇困難”。別擔心！看完這篇文章，你就能輕松get選擇的關鍵要點！一、概念解析ChIP-seq即染色質免疫沉淀測序，將ChIP與高通量測序結合。先在活細胞中固定蛋白質-DNA復合物，超聲或酶切染色
DAP-seq助力揭示多年生黑麥草轉錄因子LpNAC22增強耐旱性的分子機制2025/07/08
2025年6月10日，西北農林科技大學秦濤教授團隊在Plant,Cell&Environment發表了題為“NACTranscriptionFactorLpNAC22PositivelyRegulatesDroughtToleranceinPerennialRyegrass”的研究論文。該研究從多年生黑麥草中分離出干旱誘導的NAC轉錄因子LpNAC22，借助DAP-seq系統解析了LpNAC22通過調控LEA家族基因增強耐旱性的分子機制，為牧草抗旱分子育種提供了關鍵理論依據與基因靶點。研究背景多
[收藏] DAP-seq技術從原理到應用的實戰攻略2025/07/07
一、技術原理在植物科學的研究中，解析轉錄因子與DNA的互作機制，是構建基因表達調控網絡的核心基礎。傳統的ChIP-seq技術依賴高質量特異性抗體，這一局限性使非模式植物的研究面臨巨大挑戰。DAP-seq（DNAAffinityPurificationSequencing，DNA親和純化測序）技術的出現，為研究模式和非模式植物基因表達調控機制，提供了高效解決方案。DAP-seq的原理是通過體外表達出含有標簽（如His、Halo標簽）的目的蛋白，并將其與標簽特異性配體結合，然后富集DNA，使用高通量
蛋白互作研究全攻略：常用方法+避坑指南2025/06/30
在生命微觀尺度下，蛋白質是極為關鍵的生物大分子，廣泛參與細胞結構維系、物質轉運、新陳代謝催化、信號傳導調控等生命活動，是生命活動的重要基石。蛋白質功能的發揮依賴蛋白質-蛋白質相互作用（PPI），PPI參與細胞內眾多生理過程，如基因表達調控、信號傳導調控等。以信號傳導為例，細胞接收信號后通過蛋白質間有序的相互作用傳遞放大信號，引發生理響應，因此PPI是細胞正常生理功能實現的核心機制，異常時易引發多種疾病。探究其作用機制和規律是生命科學領域的重要課題。蛋白質相互作用可以分為穩定相互作用和瞬時相互作用
Plant Physiol | DAP-seq和RNA-seq聯合助力揭示黃瓜皮色調控新機制2025/06/23
研究背景黃瓜不僅為全球廣泛種植的蔬菜之一，也是中國重要的蔬菜作物之一，具有重要的經濟價值。果皮顏色是黃瓜品質性狀的重要標準，它能夠大大影響消費者的選擇，具有重要的商品價值。果皮的顏色主要取決于色素的含量和形成，其中葉綠素、類胡蘿卜素和類黃酮化合物等的含量是影響果皮顏色的主要因素。目前雖已鑒定出多個調控果皮顏色的基因，但其參與顏色調控的分子機制尚不明確。文獻解讀2025年6月，中國農業大學任華中/劉興旺團隊在PlantPhysiology發表了題為“ThetranscriptionfactorCs
【技術干貨】表觀轉錄組之m6A甲基化修飾（一）2025/06/16
m6A(N6-Methyladenosine)甲基化修飾已成為近年來科研圈的“明星”（通過Pubmed檢索"m6A"關鍵詞，可以看出近10年內m6A的文章逐年增長，作為表觀轉錄組中化學修飾之一，m6A在多種生理過程中發揮著調控基因表達的關鍵作用。在了解m6A甲基化修飾之前，我們先了解一下什么是表觀轉錄組。表觀轉錄組表觀轉錄組（Epitranscriptome）指RNA分子上所有可逆化學修飾的集合，這些修飾不改變RNA序列，但可以通過調控基因表達（如翻譯、降解、剪接等）發揮作用。RNA修飾廣泛存在
Plant Journal | DAP-seq助力揭示紫花苜蓿MsMYB35調控花藥發育的分子機制2025/06/16
研究背景紫花苜蓿（MedicagosativaL.）作為全球重要的優質牧草之一，其雜交育種對提升產量和品質至關重要。然而，作為異花授粉的異源四倍體作物，苜蓿的基因組復雜性使其雄性不育的分子機制長期成謎。花藥發育作為植物生殖的核心過程，涉及絨氈層分化、花粉壁形成等精密環節，而MYB家族轉錄因子在擬南芥等模式植物中已被證實為關鍵調控因子，但在苜蓿中仍未得到充分研究。文獻解讀2025年3月17日，吉林農業大學徐博教授團隊在PlantJournal發表了題為“Anther-specificexpress
【科研干貨】蛋白與DNA互作驗證全攻略：常用方法+避坑指南2025/06/16
在生命科學領域，蛋白質與DNA的相互作用構成了生命活動的分子基礎，精準調控著基因表達、細胞命運決定和遺傳信息傳遞等關鍵生物學過程。這種精密的分子互作機制不僅維持著生物體的正常生理功能，更在揭示生命本質、開發疾病診療新策略（如靶向藥物設計）、推動農業遺傳改良（如作物抗逆基因調控）等領域提供了重要的理論依據。當我們通過DAP-seq、ChIP-seq、Cut&Tag等高通量測序技術或者其他研究方法篩選到蛋白質與DNA的相互作用后，在進行點對點驗證（即特定蛋白-特定DNA位點的互作驗證）時，常用的經典
Plant Physiol | DAP-seq助力揭示番茄果實成熟調控新機制2025/06/10
研究背景番茄是全球廣泛種植的作物，其肉質果實富含類胡蘿卜素、維生素和酚類化合物，具有重要的經濟價值。成熟是一個復雜且受到嚴格調控的發育過程，會顯著改變果實的顏色、質地、風味和香氣。這一過程由植物激素和遺傳調控因子之間的復雜相互作用驅動。C2H2型鋅指轉錄因子在植物生長、發育和抗逆性中具有重要作用，但其在果實成熟中的具體功能仍缺乏研究。文獻解讀2025年1月，中國農業大學園藝學院郭仰東/張娜團隊在PlantPhysiology（IF=6.5）發表了題為“ProteinphosphatasePP2C
J. Adv. Res. | DAP-seq助力解析大麥HvbZIP87基因讓小麥抗病又高產的新機制2025/06/03
研究背景小麥是全球范圍內消費量最大,廣泛種植的糧食作物之一。然而由于種植品種單一、全球氣候變暖等原因，小麥條銹病、葉銹病、白粉病等葉部真菌病害在我國不同麥區均有發生，嚴重威脅我國小麥生產與糧食安全。SAR是植物的一種廣譜防御機制，在初次接觸病原體后被激活。盡管SAR在模式植物如擬南芥中已被廣泛研究，但在小麥和大麥等禾本科作物中的分子機制仍不明確。如何利用植物SAR過程關鍵基因提升作物抗病水平，是植物免疫學領域從抗病分子機制研究到關鍵基因開發利用的重要科學問題。文獻速遞2025年5月6日，河北農大
Plant Physiol | DAP-seq助力揭示楊樹根系抗旱新機制2025/05/26
在全球氣候變暖背景下，干旱已成為威脅植物生長的重大挑戰。在植物中，根系是干旱脅迫信號的主要感知器，其發育直接影響抗旱能力。然而，在樹木中不定根（ARs）和側根（LRs）對非生物脅迫的協調反應所依據的理論仍不清晰。近日，東北林業大學-楊靜莉研究團隊在PlantPhysiology（IF=6.5）發表題為PuUBL5-mediatedZINCFINGERPROTEIN1stabilityiscriticalforrootdevelopmentunderdroughtstressinPopulusus
探秘表觀遺傳研究2025/05/19
經典遺傳學理論認為，DNA堿基序列作為遺傳信息的載體可以將親代性狀遺傳給子代。近年來，隨著對染色質和組蛋白的深入研究，表觀遺傳學逐漸興起。表觀遺傳是指在DNA序列不發生改變的前提下，基因表達和表型發生可遺傳變化的現象。在表觀遺傳研究領域，選擇合適的研究技術至關重要。DAP-seq、ChIP-seq、CUT&Tag、ATAC-seq是表觀遺傳研究的常用技術，該如何選擇呢？接下來，小編將深入剖析這些技術，助您找到表觀遺傳研究的得力“助手”。一、技術原理?DAP-seq：體外探索蛋白-DNA互作的先鋒
Mol Hortic | DAP-seq助力揭示軟棗獼猴桃果實變色機制2025/05/19
軟棗獼猴桃近年來備受青睞，它果實小巧，皮薄多汁，富含花青素，口感清甜，深受消費者喜愛。目前，雖然已有部分獼猴桃種質基因組相關研究，但對于軟棗獼猴桃，尤其是紅色果肉品種的基因組解析仍存在空白！2025年4月，中國農業科學院鄭州果樹研究所齊秀娟團隊在MolecularHorticulture（IF=10.6）期刊發表了題為“Chromosome-levelgenomeassemblyassistingfordissectingmechanismofanthocyaninregulationinkiw
文章分享|ChIP-seq：如何解開擬南芥復制應激謎團？2025/05/13
2023年7月，在《MolecularPlant》期刊上發表的一篇研究論文“DistinctiveａndcomplementaryrolesofE2Ftranscriptionfactorsduringplantreplicationstressresponses”，該研究以擬南芥為對象，探究E2FA和E2FB轉錄因子在植物應對復制應激反應中的作用。DNA精確復制對生物遺傳穩定性至關重要，但多種因素會引發復制應激，威脅基因組完整性。植物受脅迫時觸發的DDR可能與復制應激增加有關，其DDR依賴AT
一文速覽 CUT&Tag 技術！2025/05/13
在表觀遺傳學的研究領域中，蛋白質與DNA的相互作用一直是探索基因表達調控奧秘的關鍵所在。而CUT&Tag（CleavageUnderTargets&Tagmentation）技術，即靶向剪切及轉座酶技術，作為一種高效的研究手段，正逐漸成為眾多科研人員的得力助手。什么是CUT&Tag技術？CUT&Tag技術是一種高效研究蛋白質與DNA相互作用的表觀遺傳學方法。它憑借自身的技術原理和顯著優勢，在生命科學研究領域大放異彩。核心原理l抗體引導靶向結合使用特異性抗體（一抗）識別并結合目標蛋白（如轉錄因子、
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