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藍景科信河北生物科技有限公司
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DAP-seq技術在研究木薯響應干旱脅迫分子機制中的應用2022/10/28
木薯（ManihotesculentaCrantz）是一種重要的熱帶作物，是熱帶和亞熱帶干旱地區的主要糧食作物之一。干旱脅迫嚴重影響木薯的產量和品質。鑒定木薯中重要的抗旱基因，對于培育抗旱高產木薯新品種具有非常重要的意義。2022年9月1日，中國熱帶農業科學院熱帶生物技術研究所功能基因研究組的最新研究成果，在學術期刊PlantBiotechnologyJournal上發表，文章題目為“ACC-typeglutaredoxin,MeGRXC3,associateswithcatalasesａndn
客戶文章-DAP-seq在調控金銀花綠原酸生物合成研究中的應用2022/10/21
綠原酸(CGA)是灰氈毛忍冬(Loniceramacranthoides，別稱：金銀花)最重要的活性藥物成分，在醫學領域對天然CGA的需求急劇增長。雖然CGA生物合成的關鍵基因已有報道，但其轉錄調控機制在很大程度上仍然是未知的。因此，研究CGA生物合成的分子調控機制對于利用基因工程技術培育高CGA含量的金銀花新品種具有重要意義。2021年4月29日，重慶文理學院園林與生命科學學院陳澤雄教授的研究成果，發表在植物科學領域的學術期刊PlantScience上，文章題目為“AR2R3-MYBtrans
客戶文章-DAP-seq應用OsCCA1調控水稻適應非生物脅迫機制研究2022/09/07
近日，中科院植物所王雷研究組在PlantPhysiology期刊上發表了題為“RiceCIRCADIANCLOCKASSOCIATED1transcriptionallyregulatesABAsignalingtoconfermultipleabioticstresstolerance”的研究成果。該研究揭示了OsCCA1調控水稻適應鹽脅迫、干旱脅迫以及滲透脅迫的分子機制。其中，該研究使用了DNA親和純化測序技術（DAP-seq，DNAAffinityPurificationSequencin
DAP-seq文章-應用于鑒定玉米ZmR1靶基因及對花青素合成調控研究2022/09/06
近日，北京市農林科學院玉米DNA指紋及分子育種北京市重點實驗室、齊魯師范大學玉米分子育種研究院的共同研究成果，于2022年7月5日在TheoreticalａndAppliedGenetics上發表(影響因子為5.574)，題目為“AnewlycharacterizedalleleofZmR1increasesanthocyanincontentinwholemaizeplantａndtheregulationmechanismofdiferentZmR1alleles”。本文主要研究內容是鑒定了
DAP-seq技術實驗流程和原理和適用物種（對象）范圍2022/09/06
DAP-seq在基因組水平上，鑒定轉錄因子的結合位點（transcriptionfactorbindingsites,TFBS）非常重要。ChIP-seq是進行體內檢測TFBS的主要方法。然而，ChIP-seq依賴于抗體質量，這對低表達的蛋白質具有很大的挑戰性。所以，ChIP-seq通常在規模上受到限制，難以進行高通量擴展。因此，只有少數轉錄因子可以獲得結合位點信息，大量TFBS的覆蓋范圍僅適用于人類和一些模式生物。DAP-seq具有與ChIP-seq同樣的功能。通過體外蛋白表達技術，表達出帶有
ThePlantCell：DAP-seq應用于水稻氣孔開度調控機制文章2022/09/06
2022年8月5日，揚州大學江蘇省作物遺傳生理國家重點實驗室、糧食作物現代產業技術協同創新中心的聯合研究成果在線發表在ThePlantCell上，文章題目為“Phytochromeinteractingfactorregulatesstomatalaperturebycoordinatingredlightａndabscisicacid”。該期刊的影響因子為12.085。本研究使用DAP-seq技術發現水稻OsPIL15轉錄因子靶向OsABI5，進一步研究表明，OsPIL15與OsHHO3相互作
DNA Pull Down常見問題2021/11/04
Q1：DNAPullDown的原理是什么？A：DNAPullDown是根據啟動子區域，設計DNA探針并進行生物素標記，標記的探針結合到鏈霉親和素修飾的磁珠上，形成磁珠-探針復合體。將磁珠-探針復合體與提取的蛋白孵育，鑒定與DNA探針有特異性結合的蛋白質。Q2：探針的設計原則是什么，長度為多少個堿基比較合適？A：啟動子的長度一般為100-1000bp，我們建議選擇起始密碼子上游1000bp的序列，根據這1000bp的序列，來設計DNA探針。我們建議探針長度在100bp-500bp之間，如果探針序列
ChIP-Seq, DAP-Seq與ATAC-Seq異同及各自優勢2021/07/01
染色質免疫共沉淀ChromatinImmunoprecipitation,ChIP技術是在活細胞狀態下固定蛋白質－DNA復合物，并將其隨機切斷為一定長度范圍內的染色質小片段，然后通過免疫學方法沉淀此復合體，特異性地富集目的蛋白結合的DNA的片段，通過對目的片斷的純化與檢測，從而獲得蛋白質與DNA相互作用的信息。該技術通過蛋白質與DNA互作來分析目標基因活性以及已知蛋白質的靶基因，被廣泛應用于體內轉錄調控因子與靶基因啟動子上特異核苷酸序列結合方面的研究。CHIP不僅可以檢測體內反式因子與DNA的動
BBRC：DAP-seq解析擬南芥ABA-PIFs信號通路2021/06/25
敏色素互作因子（PIFs）廣泛存在于苔蘚到被子植物中，并在植物從暗形態建成到光形態建成的轉化過程中發揮關鍵調控作用。PIFs直接與靶基因啟動子區域的順式作用元件結合，調控基因表達，或者與其它調控因子形成復合物，共同調控靶基因表達，PIFs是基因轉錄調控網絡中的核心，通過整合內部和外部的信號以實現對植物體生長發育的調控。植物激素脫落酸（AbscisicAcid，ABA）調控植物的生長發育和對逆境脅迫的響應。ABA信號通路的很多組分已經被鑒定出來。越來越多的證據證明，ABA與PIFs轉錄因子家族在光
DAP-seq助力胡楊耐鹽機制的研究2021/04/07
2019年9月，北京林業大學和藍景科信合作，在植物學主流學術期刊JournalofExperimentalBotany上（IF=5.36），發表了題為“PopuluseuphraticaWRKY1bindsthepromoterofH+-ATPasegenetoenhancegeneexpressionａndsalttolerance”的研究成果。該研究借助DNA親和純化測序技術（DNAAffinityPurificationSequencing，DAP-seq），深入揭示了胡楊耐鹽的分子機制。
藍景科信DAP-seq（DNA親和純化測序）實驗流程2021/04/01
一、蛋白表達載體構建1.1.蛋白表達載體構建試劑高保真PCR預混液，瓊脂糖凝膠回收試劑盒，同源重組克隆試劑盒，DH5α感受態細胞，高純度質粒小提試劑盒。1.2.蛋白表達載體構建方法1.2.1.根據基因CDS序列，設計上游和下游引物并進行引物合成。1.2.2.使用高純度質粒小提試劑盒提取含有CDS序列的質粒模板，或者使用客戶提供的質粒模板，對目的CDS進行PCR擴增。1.2.3.PCR反應程序1.2.4.PCR產物回收PCR結束后，進行瓊脂糖凝膠電泳。使用瓊脂糖凝膠回收試劑盒，對目的條帶進行膠回收
藍景科信DAP-seq（DNA親和純化測序）已做物種都有什么2021/03/23
（DAP-seq已做物種）DAP-seq已經做過的物種都有什么藍景科信是國內shoujia商業化DAP-seq機構，具有豐富的實驗經驗，專業高效服務50多家院校機構。藍景科信為您提供DAP-seq全流程技術服務和個性化數據分析，具有50多個物種，300多個轉錄因子的實戰經驗。藍景科信DAP-seq已做物種：擬南芥，煙草，水稻，小麥，藜麥，玉米，大豆，棉花，苜蓿，高粱，大麥草，百脈根，油菜，白菜，黃瓜，菜心，番茄，荔枝，香蕉，葡萄，蘋果，柑橘，甜橙，桃，甜瓜，甘蔗，櫻桃，草莓，杜梨，芍藥，棗，核桃
ChIP-seq常見問題（體內檢測組蛋白和轉錄因子結合位點）2021/03/23
ChIP-seq染色質免疫共沉淀測序常見問題1.Input和IP樣本之間的關系是什么？Input和IP屬于兩個樣本，在前期檢測、建庫、測序都是平行進行的，但是分析中需要將兩個樣本的測序數據進行整合分析，得出終的peak結果，并進行后續分析。2.Input是什么？有什么作用？我們將DNA或者RNAfragmentation后，在進行免疫沉淀前，需要取一部分斷裂后的染色質做Input對照（不進行免疫沉淀過程）。Input是斷裂后的基因組DNA或者RNA，需要與沉淀后的樣品DNA/RNA一起經過逆轉交
EMSA電泳遷移率實驗中常見的問題（可用于DAP-seq的后續驗證）2021/03/23
EMSA常見問題1、EMSA原理及方法EMSA稱凝聚阻滯實驗或凝膠電泳遷移率檢測，是一種用于研究轉錄因子和其相關的DNA結合序列相互作用的技術，能對各類轉錄因子的DNA結合活性進行定性和半定量分析，是一項研究細胞信號轉導通路的關鍵實驗技術。EMSA主要基于蛋白-探針復合物在在凝膠電泳過程中遷移較慢的原理。根據實驗設計特異性和非特異性探針，當核酸探針與樣本蛋白混合孵育時，樣本中可以與核酸探針結合的蛋白質與探針形成蛋白-探針復合物；這種復合物由于分子量大，在進行聚丙烯酰胺凝膠電泳時遷移較慢，而沒有結
DAP-seq（DNA親和純化測序）的成功率怎么樣2021/03/23
DAP-seq（DNA親和純化測序）技術服務——高通量檢測轉錄因子或DNA結合蛋白在基因組上的結合位點。DAP-seq技術的出現，使TFBS的研究不再局限于物種，不再受抗體質量的限制，為生命科學和醫學領域轉錄因子的研究提供了新的有效工具。藍景科信為您提供DAP-seq全流程技術服務和個性化數據分析，具有50多個物種，300多個轉錄因子的實戰經驗。藍景科信是國內shoujia商業化DAP-seq機構，擁有豐富的實戰經驗，專業高效服務50多家院校單位。DAP-seq成功率怎么樣藍景科信發表文章列表：
藍景科信DAP-SEQ（DNA親和純化測序）技術服務常見問題2021/03/22
DAP-SEQ技術簡介DAP-SEQ是基于DNA親和純化，通過體外表達轉錄因子鑒定TFBS的技術，具有不受抗體和物種限制，且高通量的優勢，自該技術問世以來，已被廣泛應用于轉錄調控和表觀組學的研究。那么關于DAP-SEQ都有哪些問題需要關注呢？1.DAP-seq原理、技術流程，能解決什么樣的問題?原理：體外表達的蛋白和DNA進行親和純化，將與蛋白結合的DNA洗脫后進行高通量測序。技術流程：將編碼轉錄因子的CDS序列構建到含有親和標簽的載體中，構建蛋白表達載體，進行體外蛋白表達，形成轉錄因子和親和標
DAP-seq（DNA親和純化測序）新技術助力轉錄因子的研究2021/03/19
DAP-seq新技術助力轉錄因子研究DAP-Seq（DNA親和純化測序）技術出現：2016年5月，來自美國Salk研究所的科學家們在Cell期刊發表題為“CistromeａndEpicistromeFeaturesShapetheRegulatoryDNALandscape”的文章（IF=28.71）。該研究開發了一項新技術：DAP-Seq（DNA親和純化測序），用于快速繪制轉錄因子調控靶向DNA區域的圖譜：順反組（cistrome）的蛋白質結合區域的景觀圖。構建完整的順反組和表觀組圖譜（epi
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